ออลนิปปอนแอร์เวย์ส (ANA) และ เจแปนแอร์ไลน์ (JAL) แถลงในช่วงเช้าของวันนี้ (21 เมษายน) ว่า เกิดเหตุขัดข้องในระบบควบคุมการจราจรทางอากาศของสนามบินฮาเนดะ ส่งผลให้เที่ยวบินภายในประเทศมีการยกเลิกและล่าช้าอย่างต่อเนื่อง โดยเฉพาะเที่ยวบินที่เดินทางเข้าและออกจากฮาเนดะ
แม้ระบบจะกลับมาใช้งานได้ตามปกติหลังเกิดเหตุประมาณ 15 นาที แต่ปัจจุบันยังคงมีความล่าช้าสะสมต่อเนื่องไปยังเที่ยวบินที่เข้า-ออกจากสนามบินอื่น ๆ ด้วยเช่นกัน
โดย ANA ได้ยกเลิกเที่ยวบินที่เดินทางเข้า-ออกจากสนามบินฮาเนดะและสนามบินอื่น ๆ รวม 30 เที่ยวบินในวันนี้ ซึ่งคาดว่าจะกระทบผู้โดยสารประมาณ 5,700 คน
ด้าน JAL ระบุว่า ณ เวลา 08:00 น. มีเที่ยวบินล่าช้าประมาณ 40 เที่ยวบิน กระทบผู้โดยสารราว 5,000 คน นอกจากนี้ ยังมีการประกาศยกเลิกเที่ยวบินรวม 53 เที่ยวบิน ซึ่งส่วนใหญ่เป็นเที่ยวบินเข้า-ออกจากฮาเนดะ โดยคาดว่าจะมีผู้ได้รับผลกระทบรวมกว่า 8,000 คน
โดยขณะนี้ ทางกระทรวงที่ดิน โครงสร้างพื้นฐาน การขนส่ง และการท่องเที่ยวของญี่ปุ่น กำลังเร่งตรวจสอบสาเหตุของความขัดข้องดังกล่าว พร้อมกันนี้สายการบินต่าง ๆ ยังได้ประกาศขอความร่วมมือให้ผู้โดยสารตรวจสอบสถานะการเดินทางล่าสุดผ่านทางเว็บไซต์หลักหรือช่องทางออนไลน์อย่างใกล้ชิด เนื่องจากยังคงมีความเป็นไปได้ที่จะเกิดความล่าช้าขึ้นอีก