เมื่อเวลา 16:13 น. ตามเวลาท้องถิ่นของวันนี้ (3 ก.ค.) ได้เกิดแผ่นดินไหวในหมู่บ้านโทชิมะ บนเกาะอาคุเซกิ จังหวัดคาโกชิมะ โดยมีจุดศูนย์กลางของแผ่นดินไหวอยู่บริเวณนอกชายฝั่งหมู่เกาะโทการะ ลึกลงไปใต้ดินประมาณ 20 กิโลเมตร ขนาดของแผ่นดินไหวอยู่ที่ 5.5 แมกนิจูด วัดแรงสั่นสะเทือนได้สูงสุดที่ระดับ 6- ตามมาตรวัดของญี่ปุ่น
ตามข้อมูลจากที่ว่าการหมู่บ้านโทชิมะ ระบุว่า ขณะเกิดแผ่นดินไหวนั้น บนเกาะมีชาวบ้านอาศัยอยู่ 66 คน และมีผู้ที่มาจากนอกเกาะอีก 8 คน นอกจากนี้ยังมีชาวประมงอีก 2 คนที่ออกไปหาปลา รวมทั้งหมด 76 คน โดยทุกคนปลอดภัยดี ไม่มีผู้บาดเจ็บ และทั้งหมดได้อพยพไปยังสนามของโรงเรียนอาคุเซกิหลังเกิดเหตุทันที
อย่างไรก็ตาม ขณะนี้ยังไม่มีประกาศแจ้งเตือนคลื่นสึนามิจากแผ่นดินไหวครั้งนี้แต่อย่างใด
เฉพาะในวันนี้วันเดียว ยังสามารถวัดแรงสั่นสะเทือนระดับ 4 ได้อีก 5 ครั้ง และระดับ 3 อีก 6 ครั้ง นอกจากนี้ ตั้งแต่วันที่ 21 มิถุนายนที่ผ่านมา จนถึงเวลา 16:00 น. ของวันนี้ รวมเป็นเวลา 12 วัน พบว่ามีแผ่นดินไหวที่มีแรงสั่นสะเทือนตั้งแต่ระดับ 1 ขึ้นไปเกิดขึ้นอย่างต่อเนื่องแล้วทั้งหมด 1,031 ครั้ง
ด้านกรมอุตุนิยมวิทยาของญี่ปุ่นได้จัดแถลงข่าวด่วน พร้อมเรียกร้องให้ประชาชนระมัดระวังแผ่นดินไหวที่มีแรงสั่นสะเทือนประมาณระดับ 6- ต่อไปในระยะนี้ และขอให้หลีกเลี่ยงการเข้าไปในสถานที่อันตราย เว้นแต่มีเหตุจำเป็นจริง ๆ เนื่องจากความเสี่ยงที่บ้านเรือนจะพังถล่ม หรืออาจเกิดภัยพิบัติดินถล่มยังคงเพิ่มสูงขึ้น