เมื่อช่วงเช้าของวันที่ 1 กรกฎาคมที่ผ่านมา เจ้าหน้าที่ตำรวจและเจ้าหน้าที่ดับเพลิงของ จังหวัดอิชิกาว่า ได้ระดมกำลังกันออกค้นหาเด็กชายวัย 10 ปี นักเรียนชั้นประถมศึกษาปีที่ 5 ของโรงเรียนการศึกษาพิเศษ ซึ่งตั้งอยู่ในพื้นที่หุบเขาของเมืองโคมัตสึ หลังสูญหายไปจากโรงเรียนเป็นเวลา 1 วันเต็ม ก่อนจะพบว่าเด็กชายได้เสียชีวิตลงแล้ว

เหตุการณ์เกิดขึ้นเมื่อวันที่ 30 มิถุนายน เวลาประมาณ 11.00 น. เด็กชายได้ขออนุญาตไปเข้าห้องน้ำและเดินออกจากห้องเรียนไป ซึ่งหลังจากผ่านไป 30 นาทีแล้วเด็กยังไม่กลับมา ทางครูใหญ่จึงได้รีบโทรศัพท์แจ้งเหตุด่วนเหตุร้ายแก่เจ้าหน้าที่ตำรวจในเวลา 11.30 น.
ในการค้นหาช่วงแรก เจ้าหน้าที่พบรองเท้าสำหรับใส่ภายในอาคารของเด็กชายตกอยู่บริเวณคันนาข้างโรงเรียน นอกจากนี้ ภาพจากกล้องวงจรปิดระหว่างทางยังสามารถบันทึกภาพเด็กชายขณะกำลังวิ่งอยู่บนถนน มุ่งหน้าไปยัง ‘น้ำตกจูนิกะทากิ’ ซึ่งอยู่ห่างจากโรงเรียนประมาณ 1.5 กิโลเมตร

จนกระทั่งในวันที่ 1 กรกฎาคม เวลาหลัง 11.00 น. (ประมาณ 24 ชั่วโมงหลังเกิดเหตุ) เจ้าหน้าที่ตำรวจและเจ้าหน้าที่ดับเพลิง รวมถึงนักดำน้ำกว่า 200 นาย ได้ปูพรมค้นหาจนพบร่างของเด็กชายจมอยู่ภายในแอ่งน้ำใต้หน้าน้ำตก ก่อนจะนำตัวส่งโรงพยาบาลและยืนยันการเสียชีวิตในเวลาต่อมา
นายเซกาวะ ชินจิ ครูใหญ่ของโรงเรียนได้แถลงแสดงความเสียใจและขออภัยต่อเหตุการณ์ที่เกิดขึ้น พร้อมระบุถึงข้อผิดพลาดในการดูแล โดยคาดว่าเด็กชายอาจเปิดประตูหนีไฟบริเวณข้างห้องน้ำเพื่อออกไปสู่ภายนอกอาคาร ซึ่งจากการตรวจสอบพบว่าในวันเกิดเหตุประตูดังกล่าวไม่ได้ลงกลอนเอาไว้ แม้ปกติจะมีมาตรการให้ล็อกอยู่เสมอก็ตาม ทั้งนี้ ตัวกลอนล็อกระบบเดิมติดตั้งอยู่ในระดับความสูงที่เด็กสามารถเอื้อมถึงและปลดล็อกเองได้หากมีแรงพอ

ทางโรงเรียนเปิดเผยว่า หลังจากนี้จะเร่งทบทวนมาตรการความปลอดภัย โดยเตรียมพิจารณาติดตั้งกลอนประตูทางเข้าออกทุกจุดให้อยู่ในระดับที่สูงเกินกว่ามือเด็กจะเอื้อมถึง เพื่อป้องกันไม่ให้เกิดอุบัติเหตุซ้ำรอย
ขณะที่เจ้าหน้าที่ตำรวจกำลังเร่งสืบสวนหาสาเหตุการเสียชีวิตและลำดับเหตุการณ์อย่างละเอียด โดยยังไม่ตัดประเด็นเรื่องอุบัติเหตุหรือคดีอาชญากรรมออกไป